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exosome lncRNA-Seq
     exosome来源于晚期核内体(也称为多囊泡体)的囊泡,是由活细胞分泌的而来,是一类大小介于30-100nm的含有RNA和蛋白质的微囊,几乎所有 类型的细胞都能分泌,广泛存在于各种体液中,特别是存在于外周血循环系统。目前的研究发现外周血循环exosome包含有蛋白质、脂质,还有种类丰富的各 类核酸分子,特别miRNA、piRNA和lncRNA。这些核酸分子被exosome的脂膜所包裹和保护,在细胞间通信中发挥重要的生物学功能,并有望 成为液体活检的重要分子标志物。
    通过exosome lncRNA测序技术,具有以下医学意义:
    ·开发针对复杂疾病的无创早期检测标志物,提高诊断的特异性和灵敏性;
    ·指导针对复杂疾病特别是肿瘤的个性化治疗;
    ·用于疾病的预后判断,特别是循环系统疾病和肿瘤
外周血循环RNA存在形式示意图
     锐博生物在全球领先研发出外周血循环exosome RNA富集和提取技术,并结合微量RNA建库测序技术,提供外周血循环exosome lncRNA研究整体解决方案,为广大的生物医学研究提供最前沿和高质量的技术服务。



测序模式

     Illumina HiSeq 3000/2500
     PE150/PE100测序
     >10G clean data
     适用物种:人、大鼠、小鼠
     样本类型:血清或血浆
信息分析
    1、去除接头序列及低质量reads的处理
    2、测序质量评估
    3、参考基因组比对
    4、全基因组reads分布图谱
    5、RNA均一性分析
    6、RNA序列完整性分析
    7、mRNA一:已知mRNA鉴定
    8、mRNA二:mRNA表达量计算及样品间表达差异分析
    9、mRNA三:差异基因KEGG生物通路富集分析
    10、mRNA四:差异基因GO功能富集分析
    11、lncRNA一:已知lncRNA鉴定
    12、lncRNA二:计算已知lncRNA表达量及样品间lncRNA表达差异分析
    13、lncRNA三:预测新lncRNA
    14、lncRNA四:计算新lncRNA表达量及样品间新lncRNA表达差异分析
案例解读
实测样本:某份人源血清exosome lncRNA测序
检测结果中:
编码基因约7000个;lncRNA基因约3000个;
mRNA转录本约10000个,lncRNA转录本约5000个
新lncRNA检测:可检测出超过2000新lncRNA转录本
基因完整度检测:横轴为转录本度覆盖度,纵轴为转录本所占比例
转录本覆盖均一性/偏好性检测
说明:reads在转录本上分布较为均一,无3"或5"偏好性

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