有参考基因组序列的lncRNA测序
标准数据分析
1、去除接头序列及低质量reads的处理
2、测序质量评估
3、核糖体RNA去除率计算
4、参考基因组比对
5、全基因组reads分布图谱
6、mRNA一：已知mRNA鉴定
7、mRNA二：mRNA表达量计算及样品间表达差异分析
8、mRNA三：差异基因KEGG生物通路富集分析
9、mRNA四：差异基因GO功能富集分析
10、mRNA五：预测新转录本
11、mRNA六：新转录本的蛋白结构域、ORF（开放阅读框）及编码潜能鉴定
12、lncRNA一：已知lncRNA鉴定
13、lncRNA二：计算已知lncRNA表达量及样品间
lncRNA表达差异分析
14、lncRNA三：预测新lncRNA
15、lncRNA四：计算新lncRNA表达量及样品间新lncRNA表达差异分析
16、lncRNA五：新lncRNA二级结构预测个性化数据分析
1、 time series差异表达
2、 基因融合
3、 RNA编辑
4、共表达网络构建（样品数大于10）
5、 SNP分析和eQTL分析
6、基因结构优化及优化基因的表达值计算
7、蛋白互作网络分析
8、样品间可变剪切和新转录本的比较
9、lncRNA的功能分析（五个lncRNA）
10、组间差异分析
无参考基因组序列的转录组
标准信息分析
1、去除接头序列及低质量reads的处理
2、测序质量评估
3、组装
4、Unigene的GO功能注释
5、Unigene的COG分析
6、Unigene的KEGG功能富集分析
7、ORF区域及编码蛋白框(CDS)
8、Unigene表达差异分析
个性化数据分析
1、差异Unigene的GO功能注释
2、差异Unigene的COG分析
3、差异Unigene的KEGG功能富集分析
* 分析详细内容请向当地销售工程师索取