有参考基因组序列的lncRNA测序
标准数据分析
1、去除接头序列及低质量reads的处理
2、测序质量评估
3、核糖体RNA去除率计算
4、参考基因组比对
5、全基因组reads分布图谱
6、mRNA一:已知mRNA鉴定
7、mRNA二:mRNA表达量计算及样品间表达差异分析
8、mRNA三:差异基因KEGG生物通路富集分析
9、mRNA四:差异基因GO功能富集分析
10、mRNA五:预测新转录本
11、mRNA六:新转录本的蛋白结构域、ORF(开放阅读框)及编码潜能鉴定
12、lncRNA一:已知lncRNA鉴定
13、lncRNA二:计算已知lncRNA表达量及样品间
lncRNA表达差异分析
14、lncRNA三:预测新lncRNA
15、lncRNA四:计算新lncRNA表达量及样品间新lncRNA表达差异分析
16、lncRNA五:新lncRNA二级结构预测个性化数据分析
1、 time series差异表达
2、 基因融合
3、 RNA编辑
4、共表达网络构建(样品数大于10)
5、 SNP分析和eQTL分析
6、基因结构优化及优化基因的表达值计算
7、蛋白互作网络分析
8、样品间可变剪切和新转录本的比较
9、lncRNA的功能分析(五个lncRNA)
10、组间差异分析
无参考基因组序列的转录组
标准信息分析
1、去除接头序列及低质量reads的处理
2、测序质量评估
3、组装
4、Unigene的GO功能注释
5、Unigene的COG分析
6、Unigene的KEGG功能富集分析
7、ORF区域及编码蛋白框(CDS)
8、Unigene表达差异分析
个性化数据分析
1、差异Unigene的GO功能注释
2、差异Unigene的COG分析
3、差异Unigene的KEGG功能富集分析
* 分析详细内容请向当地销售工程师索取